Han pasado dos años desde el final de la Cuarta Gran Guerra Ninja. Konohagakure ha permanecido en un estado de paz y armonía, hasta que el sexto Hokage Kakashi Hatake se da cuenta de que la luna se acerca peligrosamente a la Tierra, lo que representa la amenaza de la ruina planetaria. En medio de la terrible experiencia, la Konoha es invadida por un nuevo mal, Toneri Oosutuski, quien de repente secuestra a la hermana pequeña de Hinata Hyuuga, Hanabi. Kakashi despacha un equipo ninja experto compuesto por Naruto Uzumaki, Sakura Haruno, Shikamaru Nara, Sai y Hinata en un esfuerzo por rescatar a Hanabi de las garras diabólicas de Toneri. Sin embargo, durante su misión, el equipo enfrenta varios obstáculos que los desafían, frustrando sus esfuerzos.